El bagre rayado Pangasianodon hypophthalmus tiene su hogar en el legendario río Mekong, el río más largo del sudeste asiático y la pesquería continental más grande del mundo. Vietnam se erige como el principal productor de la especie, cultivando aproximadamente 1.1 millones de toneladas de peces en un solo año. Peroa diferencia de otros peces comerciales, como el bacalao del Atlántico o el bagre de canal, existen pocos datos genómicos para guiar la acuicultura de bagre rayado.
Ahora, los científicos de la Universidad de Graduados del Instituto de Ciencia y Tecnología de Okinawa OIST se han asociado con investigadores de la Academia de Ciencia y Tecnología de Vietnam para decodificar todo el genoma del bagre rayado. Sus resultados, publicados el 5 de octubre de 2018, en Genómica BMC , revelar nuevos detalles sobre el linaje evolutivo de la especie y los genes que pueden ser clave para su desarrollo saludable.
"Con estos datos genómicos, será fácil verificar la diversificación presente en las poblaciones de bagre individuales", dijo Eiichi Shoguchi, líder del grupo de la Unidad de Genómica Marina en OIST y coautor del estudio ". En acuicultura, porejemplo, un pez individual puede ser más resistente a las enfermedades que otro. Ahora, puede verificar el genoma de ese individuo y aprender qué gen está relacionado con la resistencia a la enfermedad ".
Utilizando técnicas de secuenciación de próxima generación, los investigadores reunieron datos genómicos de alta calidad y los reunieron en un genoma completo. Compararon el nuevo genoma con los datos genómicos publicados previamente del bagre y el pez cebra, un organismo modelo estrechamente relacionado con el bagre, evolutivamenteLos científicos encontraron diferencias claras entre el bagre asiático y su primo americano, y otras diferencias entre él y su pariente el pez cebra.
En particular, identificaron la pérdida de dos genes en el bagre rayado que permanecen intactos en el pez cebra y permiten que la especie produzca su propio protector solar. El bagre se alimenta en el fondo de los ríos, más allá del alcance de los rayos UV, y probablementeno requiere esta protección. El bagre rayado tiene más genes de factor de crecimiento similares a la insulina que el pez cebra, lo que puede ser clave para su crecimiento y desarrollo saludables.
Utilizando datos de bagre de canal, los científicos elaboraron un mapa hipotético de cromosomas rayados de bagre, el andamio en forma de hilo donde se alojan los genes del pez. El mapa señala el camino para futuras investigaciones que comparen las especies, rastreen su linaje e investiguen sufunción genética Los biólogos evolutivos y los acuicultores pueden aprender del genoma rayado del bagre, ahora que ha sido decodificado.
En el futuro inmediato, los acuicultores pueden comenzar a buscar y seleccionar fragmentos óptimos de ADN, conocidos como "marcadores moleculares", en su propio bagre rayado, dijo Oanh TP Kim, jefe de laboratorio en el Instituto de Investigación del Genoma de VietnamAcademia de Ciencia y Tecnología y co-primer autor del estudio.
"La información del genoma rayado del bagre nos permitirá", dijo, "desarrollar estos marcadores moleculares y posteriormente aplicarlos en la selección asistida por marcadores moleculares para los rasgos de importancia económica en la acuicultura del bagre".
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Materiales proporcionado por Universidad de Posgrado del Instituto de Ciencia y Tecnología de Okinawa OIST . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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