La identificación de mutaciones complejas en la estructura del genoma de un organismo ha sido difícil. Pero en un nuevo estudio publicado en línea en Genética de la naturaleza , un equipo de investigación dirigido por JJ Emerson, profesor asistente de ecología y biología evolutiva en la Escuela de Ciencias Biológicas Ayala, aplica nuevos métodos de análisis del genoma para identificar estas mutaciones complejas con una resolución sin precedentes.
Su enfoque identifica una amplia variación genética en el genoma de la mosca de la fruta que previamente escapó al descubrimiento. Sus resultados ayudarán a acercar a los investigadores a comprender cómo las mutaciones complejas en los genomas impulsan la enfermedad y la evolución.
"Por primera vez en animales, hemos reunido un genoma de alta calidad, lo que permite el descubrimiento de todas las diferencias genéticas entre dos individuos dentro de una especie", dijo Mahul Chakraborty, un investigador postdoctoral en el laboratorio Emerson y primer autor deel estudio "Descubrimos una gran cantidad de variación genética oculta durante nuestros análisis, gran parte de la cual afecta rasgos importantes dentro de la mosca de la fruta común, D. melanogaster".
A diferencia de los enfoques estándar que se basan en la misma tecnología de secuenciación que entregó el llamado genoma de $ 1,000, el enfoque del equipo se basa en la reconstrucción de todo el genoma a partir de una tecnología más nueva que sea capaz de leer piezas mucho más grandes del genoma. El uso de talesLa secuenciación de moléculas largas equipó a Chakraborty y Emerson para desentrañar cambios complejos que alteran la estructura del genoma.
"Este estudio es el primero de su tipo en organismos complejos como la mosca de la fruta. Con este recurso único en la mano, ya hemos caracterizado varias variaciones estructurales candidatas que muestran evidencia de adaptación fenotípica, que puede funcionar para impulsar la evolución de las especies".dijo Emerson.
Al explorar cómo algunos de estos cambios genéticos estructurales recientemente identificados pueden contribuir a la evolución de la mosca de la fruta, el grupo se sintió atraído por una familia de enzimas que se ha asociado con la resistencia a los pesticidas y la preferencia por el frío, entre muchas otras funciones.aumenta la producción de uno de los genes en 50 veces, lo que sugiere cómo tales moscas logran una mayor resistencia a la nicotina.
Según los investigadores, el hecho de que tanta variación escapó a la atención en D. melanogaster, una especie con genomas relativamente simples a los que no les gusta ocultar la variación, sugiere que nuestros propios genomas y los de las especies que comemos están albergandouna reserva aún mayor de variaciones genéticas importantes desde el punto de vista médico y agrícola.
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Materiales proporcionados por Universidad de California - Irvine . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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