En una nueva investigación científica dirigida por el Instituto Alemán Leibniz para la Investigación de Zoológicos y Vida Silvestre Leibniz-IZW, se evaluó el agua de los pozos de agua africanos y mongoles, así como las harinas de sangre de las sanguijuelas del sudeste asiático, para determinar la capacidad de recuperar virus de mamíferos sin la necesidad depara encontrar y atrapar a los mamíferos. Los científicos analizaron las muestras utilizando secuenciación de alto rendimiento para identificar virus conocidos y virus nuevos para la ciencia. Ambos enfoques demostraron ser herramientas adecuadas para la investigación de prevención de pandemias, ya que permiten encontrar y monitorear reservorios de virus de vida silvestre.Por ejemplo, se identificó un nuevo coronavirus probablemente asociado con especies de ciervos del sudeste asiático. Los resultados se publican en la revista científica "Métodos en ecología y evolución" .
Encontrar y monitorear reservorios de virus de vida silvestre como el SARS-CoV-2, para el cual aún no se ha descubierto el reservorio, es un desafío. Muchas áreas donde habitan vida silvestre son de difícil acceso y las especies en cuestión son difíciles de encontraro capturar. Para prevenir futuras pandemias como COVID-19, se necesitan con urgencia métodos nuevos y efectivos para descubrir y monitorear los virus que circulan en la vida silvestre. Los enfoques basados en el ADN ambiental eDNA y el ADN derivado de invertebrados iDNA pueden mejorar la disponibilidadconjunto de herramientas para superar estos desafíos, cuando se combina con una secuenciación de alto rendimiento. El equipo de científicos evaluó el agua de los pozos de agua africanos y mongoles y las harinas de sangre de las sanguijuelas del sudeste asiático para determinar la capacidad de recuperar virus de ambos tipos de muestras. La limitación habitual de estas muestras es quecontienen solo pequeñas cantidades de ADN de baja calidad, particularmente ADN patógeno. Por lo tanto, el autor utilizó un enfoque moderno de "captura de hibridación" para extraer secuencias sisimilares a los de los virus vertebrados actualmente conocidos y luego los secuenciaron utilizando sofisticadas técnicas de alto rendimiento.Este enfoque tuvo éxito porque permitió la identificación de virus nuevos y conocidos en muestras de agua y sanguijuelas.
El ADN de las muestras de agua produjo varios virus comunes a las cebras y al asno salvaje, que se esperaban ya que estos animales visitan con frecuencia los pozos de agua en grandes cantidades. En el caso de los virus encontrados en los pozos de agua africanos, los autores demostraron en una publicación relacionadaque los virus todavía son infecciosos, lo que sugiere que el agua en sí misma puede ser una fuente de transmisión viral. De las sanguijuelas del sudeste asiático, se identificaron muchos virus conocidos y nuevos. De particular interés fue un nuevo coronavirus previamente desconocido para la ciencia, que potencialmenterepresenta un género completamente nuevo en la familia Coronaviridae y parece estar asociado con especies de ciervos.
"Para muchos de los virus más letales como el Ébola, todavía no sabemos de dónde vienen", dice el profesor Alex Greenwood, jefe del Departamento de Enfermedades de la Vida Silvestre. "La pandemia actual demuestra que todavía sabemos muy poco sobre ladiversidad viral en la naturaleza. Los nuevos métodos podrían ayudarnos a identificar nuevos virus y sus huéspedes potenciales sin los problemas logísticos y éticos habituales asociados con la recolección directa de muestras de vida silvestre. "El ADN ambiental está demostrando ser útil en varios contextos, incluida la caracterización de la diversidad deespecies de vida silvestre de regiones inaccesibles, el estudio de poblaciones antiguas y más recientemente en la investigación de patógenos. El ADN ambiental del agua y el ADN derivado de invertebrados chupadores de sangre pueden ser útiles en diferentes entornos. "El agua es un recurso esencial para la vida y, en particular, en áreasde escasez estacional, un punto de concentración para los animales ", dice Greenwood.
"Las sanguijuelas terrestres son a menudo muy abundantes en áreas de emergencia viral previa en el sudeste asiático y sus harinas de sangre se pueden usar para identificar a sus huéspedes mamíferos, incluidos los patógenos contenidos en su sangre", agrega el Dr. Niccolò Alfano, un ex postdoctoral de Leibniz-IZW Departamentos de Enfermedades de la Vida Silvestre y Dinámica Ecológica, ahora trabajando en la Universidad de Pavía en Italia. "Identificamos virus de mamíferos de cinco familias virales diferentes en nuestras muestras de sanguijuelas y más del 50% de las muestras contenían virus de mamíferos. Algunos de estos,como un circovirus porcino o un annellovirus de oso podrían asignarse al cerdo barbudo y al oso sol, sus hospedadores mamíferos que también se detectaron en las muestras de sanguijuelas. Lo más interesante fue el descubrimiento del nuevo coronavirus, ya que esto demostró que con nuestro métodoson capaces de descubrir patógenos virales previamente desconocidos para la ciencia que circulan en la vida silvestre ", agrega Alfano. Esto puede ayudar a identificar virus potencialmente infecciosos en unetapa temprana que puede ayudar a prevenir posibles epidemias futuras ".
Se necesitará más trabajo para caracterizar los virus recién descubiertos, como secuenciar sus genomas completos y confirmar sus relaciones entre el huésped y el virus. Además, los pozos de agua o sanguijuelas no se encuentran en todos los entornos. El suelo, las heces y otros invertebrados representan fuentes adicionalesde ácidos nucleicos que podrían usarse para complementar el muestreo directo de animales y mejorar nuestra capacidad para descubrir y monitorear virus a medida que avanzamos desde la pandemia actual y, con suerte, aprendemos a prevenirlos en el futuro.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto Leibniz para la Investigación de Zoológicos y Vida Silvestre IZW . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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