Los científicos han mapeado el genoma del pastor alemán, una de las razas caninas más populares del mundo, después de usar una muestra de sangre de 'Nala', un saludable pastor alemán de cinco años que vive en Sydney.
En un artículo publicado hoy en la respetada revista 'big data' GigaScience , un equipo global de investigadores de instituciones como UNSW Sydney detalló la gigantesca tarea de desentrañar los 38 pares de cromosomas de perro para decodificar los 19,000 genes y 2,8 mil millones de pares de bases de ADN, utilizando tecnología avanzada de secuenciación genética.
El nuevo genoma no solo proporciona a la ciencia una instantánea biológica más completa de la especie canina Canis lupus familiaris en general, sino que también ofrece una referencia para futuros estudios de las enfermedades típicas que afectan a esta raza tan querida.
opción popular
El profesor de ciencias de la UNSW, Bill Ballard, biólogo evolutivo que secuencia el genoma del dingo australiano en 2017, dice que los pastores alemanes son opciones populares en el hogar y el lugar de trabajo debido a su inteligencia natural, temperamento equilibrado y naturaleza protectora. Pero después de más deUn siglo de reproducción de las características físicas deseadas, son particularmente vulnerables a las enfermedades genéticas.
"Uno de los problemas de salud más comunes que afectan a los pastores alemanes es la displasia de cadera canina, que es una condición dolorosa que puede restringir su movilidad", dice el profesor Ballard.
"Debido a que los pastores alemanes son tan buenos perros de trabajo, se ha gastado mucho dinero buscando las causas y los predictores de este problema. Cuando los perros de trabajo, como los entrenados para trabajar con la policía o ayudar a las personas con discapacidades,- terminan teniendo displasia de cadera, entonces eso es mucho tiempo perdido y dinero invertido en el entrenamiento de ese perro.
"Ahora que tenemos el genoma, podemos determinar mucho antes en la vida si es probable que el perro desarrolle la afección. Y con el tiempo, nos permitirá desarrollar un programa de reproducción para reducir la displasia de cadera en las generaciones futuras".
perro superior
Nala, que fue descrita en el artículo como "una niña de 5,5 años fácil de tratar y accesible", fue seleccionada porque estaba libre de todas las enfermedades genéticas conocidas, incluso sin signos de displasia de cadera. Fue localizada por televisores conocidos yel veterinario de radio Dr. Robert Zammit, acreditado como autor de este artículo, quien, según el profesor Ballard, ha acumulado rayos X y muestras de sangre de más de 600 pastores alemanes.
"Ahora podremos ver esas radiografías de cadera y todo el ADN de esos perros y compararlos con esta hembra de referencia saludable", dice el profesor Ballard.
Nala no es el primer perro doméstico en proporcionar una muestra para el mapeo del genoma del perro. En 2003, un caniche llamado Shadow proporcionó una muestra que resultó en un genoma que estaba completo en un 80 por ciento, seguido dos años después por el primermapeo completo del genoma de 'Tasha' the Boxer.
máquinas de genes
Pero en la década y media desde entonces, la tecnología ha mejorado enormemente hasta el punto de que la cantidad de brechas, o regiones de bases de ADN que no se pueden leer, ha disminuido drásticamente, lo que hace que el mapeo de los genes de Nala sea el más completo hasta el momento.
"La mayor diferencia entre el mapeo actual y el 2005 es que ahora usamos secuenciación de lectura larga", dice el profesor Ballard.
"El genoma del Boxer se armó con la secuenciación 'Sanger', que puede leer alrededor de 1000 bases de longitud a la vez, mientras que la tecnología que está disponible hoy en día - secuenciación Next Generation - puede leer hasta 15,000 bases.
"Lo que esto significa es que si tienes una región de genes que está duplicada y ejecuta más de 1000 bases, la secuenciación de Sanger no podrá decirte de qué parte de los genes proviene esa secuencia en particular. Así que si hubocerca de 23,000 lagunas en el genoma Boxer de Sanger, el secuenciador Next Gen tenía poco más de 300 ".
Criado para el éxito
El genoma del pastor alemán también es un avance en el genoma Boxer de 2005 debido a la raza en sí. Como los Boxers son más especializados, con más endogamia en su historia genética, el genoma del pastor alemán es, por lo tanto, más genérico. Los autores creen que esto proporcionarámejor comprensión de la evolución de las razas de perros en general.
El profesor Ballard reconoce que esta no será la última vez que se secuenciará el genoma de una raza de perro doméstico.
"Esperaría que a medida que los costos bajen, todas las razas principales tendrán un genoma mapeado dentro de 10 años, porque esto ayudará a identificar enfermedades específicas, y muchas razas han conocido enfermedades específicas"
El proyecto del genoma del pastor alemán fue financiado por la Australian Canine Research Foundation, así como por una campaña de financiación colectiva llamada Hip to Fit.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Universidad de Nueva Gales del Sur . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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