Investigadores del Centro de Genómica y Biología de Sistemas de NYU Abu Dhabi NYUAD CGSB y el Centro de Ingeniería Genética y Biotecnología de UAEU Khalifa KCGEB, en colaboración con otras instituciones, han desarrollado un ensamblaje mejorado del genoma para la palmera datilera usando mucho tiempotecnología de secuenciación de lectura. Esta mejora con respecto a las versiones actuales del genoma ayudará a avanzar en la investigación y también informará las prácticas de propagación de esta fuente esencial de alimentos de la región MENA.
Además, los investigadores han identificado los genes y las mutaciones que conducen al cambio de color y los niveles de azúcares principales en la fruta de la palmera datilera, incluidos los genes de la enzima invertasa que descompone la sacarosa en glucosa y fructosa.El color de la fruta y los genes de azúcar se realizaron mediante estudios de asociación de genoma completo GWAS. GWAS se ha utilizado para mapear genes de enfermedades importantes en humanos, y esta es la primera vez que se aplica a las palmeras datileras.
Mientras que las palmas datileras Phoenix dactylifera es uno de los primeros cultivos de árboles domesticados en el mundo y sigue siendo uno de los principales cultivos frutales en el norte de África y Oriente Medio, existen pocos recursos genómicos.Esto, combinado con largos tiempos de generación, ha limitado los estudios genómicos evolutivos de esta especie perenne.En el documento Mapeo de asociación de genoma completo de rasgos de fruta de palmera datilera, publicado en la revista Comunicaciones de la naturaleza , los investigadores informan que han producido un ensamblaje del genoma mejorado para las palmeras datileras que es un 18 por ciento más grande y más contiguo que los ensamblajes del genoma existentes. Este ensamblaje de secuencia del genoma de lectura larga, junto con el acceso a dos grandes huertos de palmeras de dátiles maduros enlos Emiratos Árabes Unidos, les permitieron realizar un mapeo de asociación de todo el genoma en esta especie. Como resultado, mapearon con éxito el locus y los genes de determinación del sexo previamente identificados para los polimorfismos del color de la fruta y del nivel de azúcar.
El científico principal y profesor de plata de biología, Universidad de Nueva York y parte del Centro de Genómica y Biología de Sistemas de la NYU Abu Dhabi, Michael Purugganan comentó: "A medida que enfrentamos desafíos en la seguridad alimentaria para el futuro, necesitaremos continuar estudiando elEl genoma de los cultivos alimentarios como la palmera datilera para ayudarnos en nuestra lucha por proporcionar seguridad alimentaria en el mundo. Nuestro progreso en la expansión del genoma de la palmera datilera finalmente está revelando algunos de los secretos que explican cómo esta especie de árbol ha seguido prosperando en variados, ecosistemas desafiantes "
La secuenciación del genoma de la palmera datilera y el primer mapeo de GWAS en este árbol frutal fue un esfuerzo internacional liderado por NYUAD y KCGEB, y también incluyó investigadores en los EE. UU., Suiza, Francia, Reino Unido, Arabia Saudita y México.
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Materiales proporcionados por Universidad de Nueva York . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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