La secuenciación completa del genoma de las células tumorales podría ayudar a predecir el pronóstico del cáncer de un paciente y ofrecer pistas para identificar el tratamiento más efectivo, sugiere un estudio internacional publicado hoy en medicina natural .
Nuestro ADN, el genoma humano, se compone de una serie de moléculas conocidas como nucleótidos. Estas están representadas por las letras A, C, G y T. A veces, se producen cambios en la "ortografía" de nuestro ADN: una A se convierte enuna G, por ejemplo. Estos cambios, conocidos como mutaciones, pueden ser causados por varios factores, algunos espontáneos, otros ambientales, como la exposición al humo del tabaco o la luz ultravioleta, y todos dejan firmas características en el genoma.
A medida que las células se dividen y multiplican, hacen copias de su ADN, por lo que se reproducirán los errores ortográficos. Con el tiempo, la cantidad de errores se acumula, lo que lleva a un crecimiento celular descontrolado: el desarrollo de tumores.
La secuenciación del genoma completo WGS es una técnica que consiste en leer el plano genético completo de una célula cancerosa y compararlo con las células sanas de un paciente para ver cómo ha mutado el ADN. Al estudiar todas las mutaciones presentes en un genoma completo de cáncer ybuscando todas las firmas en ellos, es posible identificar los diversos factores que han actuado sobre el tumor.
Para comprender si WGS podría ser útil en un entorno clínico, los investigadores de Cambridge se unieron a colegas en Suecia para ejecutar un proyecto a nivel poblacional llamado SCAN-B, que ha estado reclutando a todas las mujeres diagnosticadas con cáncer de mama en el sur de Suecia desde 2010Esto fue crítico ya que SCAN-B tiene una gran cantidad de datos de resultados clínicos.
Esta colaboración internacional de investigadores utilizó WGS para analizar tumores de pacientes a quienes se les había diagnosticado cáncer de seno triple negativo. Estos cánceres se denominan así porque carecen de tres moléculas clave conocidas como receptores. Representan alrededor del 9% de los cánceres de senoy están asociados con peores resultados. También son más comunes entre las mujeres con ascendencia africana y asiática.
"La secuenciación del genoma completo nos da una visión completa del genoma del cáncer. Revela muchas cosas que no podíamos ver previamente, porque simplemente no las buscábamos", explica la Dra. Serena Nik-Zainal del Medical Research Council CancerUnidad de la Universidad de Cambridge, que dirigió el estudio.
"Tener un mapa completo del genoma del cáncer para cada paciente nos ayuda a comprender qué ha causado el tumor de cada paciente y tratar a cada individuo de manera más efectiva. Anteriormente, era como viajar con un mapa limitado, pero ahora, con todo el genomasecuenciación tenemos un mapa mucho mejor y más detallado y conocemos la mejor ruta para llegar a nuestro destino ".
Luego, los investigadores aplicaron un algoritmo de aprendizaje automático llamado HRDetect, que habían desarrollado previamente para identificar tumores con firmas causadas por mutaciones en los genes BRCA1 o BRCA2. Tener una variante de cualquiera de estos dos genes aumenta en gran medida el riesgo de un individuo de desarrollar mamaEl cáncer y una clase relativamente nueva de medicamentos contra el cáncer llamados inhibidores de PARP se han desarrollado específicamente para estos tumores. Los puntajes de HRDetect habían sugerido previamente que una mayor proporción de mujeres en la población general podría tener tumores muy similares a BRCA1 / BRCA2-cánceres mutantes.
Tomando las puntuaciones, el equipo clasificó a cada paciente como puntuación alta, intermedia o baja.
Los pacientes que obtuvieron un puntaje alto fueron aquellos que obtuvieron los mejores resultados utilizando los tratamientos actuales para los cánceres de seno triple negativos; también tienen más probabilidades de responder a los inhibidores de PARP
Sorprendentemente, aquellos con puntajes intermedios tuvieron los resultados más pobres. Los tratamientos actuales de cáncer de seno triple negativo tuvieron una efectividad limitada, lo que sugiere que serían necesarios nuevos enfoques para abordar estos cánceres. Sin embargo, los cambios genéticos y las firmas reveladas a través de WGS dieron pistas sobre los mecanismos que impulsanestos tumores, que a su vez pueden ayudar a informar el desarrollo de nuevos medicamentos.
Aquellos pacientes con puntajes bajos también tienen malos resultados, aunque no tan malos como los del grupo intermedio. Sin embargo, el perfil de WGS en algunos de estos tumores sugirió anormalidades biológicas que podrían ser el objetivo de las drogas existentes o las drogas que actualmente están en fase clínica.ensayos, como los llamados inhibidores de punto de control o inhibidores de AKT.
"Utilizando la secuenciación del genoma completo, podemos realmente discriminar los tumores que pueden responder o no a los medicamentos actuales entre pacientes con cáncer de mama triple negativo, un tipo de cáncer de mama que todavía nos cuesta tratar bien", dice el primer autor, el Dr. Johan Staaf deDepartamento de Ciencias Clínicas, Universidad de Lund, Suecia.
"Pero lo más importante, este enfoque también nos da pistas sobre algunos de los mecanismos que están funcionando mal en los tumores de mal pronóstico y, por lo tanto, cómo podríamos tratar esos tumores de manera diferente o cómo podríamos desarrollar nuevos medicamentos".
La velocidad de la tecnología de secuenciación ha progresado de tal manera que WGS puede llevarse a cabo en 24 horas, con otras 24-48 horas para el análisis de los datos. Por lo tanto, en teoría, debería ser posible ofrecer una detección completa del genoma como una cuestión decurso a todos los pacientes, lo que permite una lectura personal de su tumor y posibles opciones de tratamiento.
"El potencial de la secuenciación del genoma completo para abrir un enfoque personalizado para tratar el cáncer es enorme", dice el Dr. Nik-Zainal. "En el pasado, el costo y los problemas con la gestión del gran volumen de datos crearon barreras para su aplicación generalizada. Pero nos estamos acercando a un momento en el que se puede ofrecer de forma rutinaria a todos los pacientes, con el potencial de transformar el manejo de cánceres incluso difíciles de tratar ".
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Materiales proporcionado por Universidad de Cambridge . La historia original tiene licencia bajo a Licencia Creative Commons . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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