Investigadores en el laboratorio de Charles Danko en el Instituto Baker para la Salud Animal han desarrollado una nueva herramienta para estudiar "interruptores" genéticos activos en tumores de glioblastoma que impulsan el crecimiento del cáncer. En un nuevo artículo en Genética de la naturaleza identificaron interruptores clave en diferentes tipos de tumores, incluidos los interruptores relacionados con la duración de la supervivencia de un paciente.
El glioblastoma es un cáncer agresivo que se forma en el cerebro o la médula espinal. "Es una enfermedad devastadora y no hay buenas opciones de tratamiento", dijo el autor principal, Tinyi Chu, becario graduado en el laboratorio de Danko. Incluso cuando los pacientes se someten a tratamiento,la mayoría sobrevive solo 15 meses después del diagnóstico.
En el nuevo estudio, el grupo de Danko se asoció con colegas de la Universidad Estatal de Medicina de Nueva York para analizar 20 muestras de glioblastoma de su banco de tejidos.
"Muchas enfermedades, incluido el cáncer, son fundamentalmente defectos en la forma en que se usan nuestros genes, no necesariamente en los genes mismos", dijo Danko, profesor asistente de ciencias biomédicas. Los genes constituyen solo el dos por ciento de nuestro genoma.Los factores de transcripción se unen al genoma para activar y desactivar esos genes, lo que desencadena los cambios celulares que causan la enfermedad.
Para analizar los tumores, los investigadores utilizaron una técnica llamada ChRO-seq que crea un mapa de qué interruptores están activos y qué genes activan. El coautor Hojoong Kwak, profesor asistente de biología molecular y genética de Cornell, inventó inicialmente ChRO-Seq como estudiante graduado en la Universidad de Cornell, y colaboró con el grupo de Danko para desarrollar la nueva aplicación.
Utilizando datos de ChRO-seq, el equipo pudo clasificar los glioblastomas en subtipos, en función de qué interruptores particulares estaban activos en los diferentes tumores en comparación con tejidos cerebrales sanos. También identificaron tres interruptores que se probarán en estudios más grandes para determinarsu capacidad para predecir qué pacientes sobrevivirán más tiempo con la enfermedad, incluidos dos interruptores cuyas conexiones se desconocían anteriormente.
Chu ahora está analizando un grupo aún mayor de glioblastomas para vincular la supervivencia del paciente y los resultados del tratamiento con los interruptores activos en cada tumor. Espera que los resultados puedan informar planes de tratamiento personalizados para los pacientes o ayudar a desarrollar nuevas terapias en el futuro.
La nueva técnica estudia no solo el cáncer, sino muchas otras enfermedades causadas por el mal funcionamiento de la regulación génica, como ciertos tipos de enfermedades cardíacas o autoinmunes ". ChRO-seq le brinda mucha información sobre qué interruptor está activando un tumor ouna célula enferma ", dijo Danko." Te da un punto de partida para pensar cómo puedes apagar ese interruptor ".
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Materiales proporcionados por Universidad de Cornell . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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