El equipo internacional de científicos dirigido por Roderic Guigó en el Centro de Regulación Genómica de Barcelona mostró que los cambios en la expresión génica en diferentes tejidos desencadenados por la muerte pueden usarse para predecir el momento de la muerte de un individuo. Como se informó en un artículo publicado en Comunicaciones de la naturaleza esta semana, los investigadores sugieren que al analizar algunos tejidos fácilmente disponibles por ejemplo, tejido pulmonar o de la piel, el intervalo post mortem tiempo transcurrido desde la muerte se puede determinar con una precisión considerable y puede tener implicaciones para los análisis forenses.
Todo comenzó con el proyecto GTEx, que tenía como objetivo crear una base de datos de referencia y un banco de tejidos para que los científicos estudiaran cómo las variantes genómicas afectan la actividad genética y la susceptibilidad a las enfermedades. GTEx fue diseñado para tomar muestras de la mayor cantidad de tejidos posible de un gran número de individuoscon el fin de comprender los efectos causales de los genes y las variantes, y qué tejidos contribuyen a la predisposición a la enfermedad ". Los datos de GTEx nos permiten hacer preguntas sobre la variación genética y sus efectos sobre la expresión génica tanto en un tejido como en muchos tejidos. Desde las muestrasestamos utilizando todos los donantes fallecidos, necesitamos saber si hubo cambios en la expresión génica relacionados con la muerte o el momento de la muerte, para poder modelar mejor nuestras predicciones de variación entre tejidos o enfermedades ", explica Roderic Guigó, autor principal de este estudio y coordinador del Programa de Bioinformática y Genómica en el CRG.
Para comprender los cambios específicos de tejido en la expresión génica después de la muerte de una persona, Roderic Guigó y sus colegas estudiaron datos de secuenciación de ARN de más de 7,000 muestras de 36 tejidos diferentes obtenidos de 540 donantes dentro del proyecto GTEx. Muestran queEl tiempo transcurrido desde la muerte tiene un efecto sobre la expresión génica y que este efecto varía de un tejido a otro. Los autores desarrollaron modelos para la predicción del intervalo post-mortem basados en estos cambios de expresión génica específicos del tejido mediante la secuenciación de alto rendimiento de la célula.
"Descubrimos que muchos genes cambian la expresión en intervalos post mortem relativamente cortos, en gran medida de manera específica del tejido. Esta información nos ayuda a comprender mejor la variación y también nos permite identificar los eventos transcripcionales provocados por la muerte en un organismo,"agrega Pedro G. Ferreira, alumno de CRG actualmente en el Instituto de Patología Molecular e Inmunología, Universidad de Oporto en Portugal.
Los investigadores han estudiado el efecto de diferentes covariables en el análisis biológico. El modelo podría mejorarse aún más para que sea aplicable a un escenario forense y para diseñar un protocolo para la implementación potencial en la patología forense.
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Materiales proporcionado por Centro de Regulación Genómica . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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