Informes en el diario Celda , el investigador principal Dr. Ulrike Kusebauch, del Instituto de Biología de Sistemas ISB, describe los resultados de una colaboración entre científicos de ISB, ETH Zurich y varios otros institutos contribuyentes para desarrollar el SRMAtlas humano, un compendio de proteómicaensayos para cualquier proteína humana. El SRMAtlas humano es un compendio de ensayos de espectrometría de masas altamente específicos para la identificación dirigida y la cuantificación reproducible de cualquier proteína en el proteoma humano predicho, incluidos los ensayos para muchas variantes empalmadas, mutaciones no sinónimas y modificaciones postraduccionalesUsando la técnica llamada monitoreo de reacción seleccionado, los ensayos se desarrollaron con el uso de 166,174 péptidos proteotípicos sintetizados químicamente y bien caracterizados. El recurso SRMAtlas está disponible públicamente gratuitamente en http://www.srmatlas.org y beneficiará igualmente a los estudios centrados, basados en hipótesis y a gran escala de proteoma. Esperamos que este recurso avance significativamente la biología experimental basada en proteínas para comprender las transiciones de enfermedades y las trayectorias de bienestar porque cualquier proteína humana ahora puede, en principio, identificarse ycuantificado en cualquier muestra.
La capacidad de medir de manera confiable y reproducible cualquier proteína del proteoma humano en cualquier tejido o tipo de célula es transformadora para comprender las propiedades a nivel del sistema, así como las vías específicas en fisiología y enfermedad. En el laboratorio del profesor Robert Moritz en ISB,un esfuerzo de colaboración permitió la generación y verificación de un compendio de ensayos proteómicos específicos altamente específicos por el método llamado monitoreo de reacción seleccionado, o SRM para abreviar, ahora proporciona cuantificación del 99.7% de las 20,277 proteínas humanas anotadas por las ampliamente accesibles, sensibles y robustasmétodo de espectrometría de masas dirigida monitoreo de reacción seleccionado, SRM. Este SRMAtlas humano proporciona coordenadas de ensayo definitivas que identifican de manera concluyente el péptido respectivo en muestras biológicas.
Aunque el logro del Proyecto del Genoma Humano en 2003 al crear un inventario de todos los genes humanos, la mayoría de la investigación de proteínas todavía se centra en el mismo subconjunto relativamente pequeño de proteínas que se exploraron antes de mapear el genoma humano. Para ir más alláEn este enfoque de investigación proteogenómica estancada, se necesitaba el desarrollo de ensayos altamente específicos para esencialmente cada proteína humana. Con un recurso como el SRMAtlas humano, la posibilidad de medir cualquier proteína ahora es una realidad. El SRMAtlas humano ahora proporciona ensayos verificados de MS basados enLa tecnología SRM se desarrolló en un proceso uniforme y consistente para esencialmente cada proteína del proteoma humano. Estos ensayos pueden implementarse rápidamente en biología de sistemas y estudios biomédicos para identificar y cuantificar cualquier proteína humana con alta sensibilidad y alta selectividad, y para navegar en mapas completos de proteomapara entender sus funciones biológicas.
La medicina personalizada dependerá de las firmas moleculares para controlar el estado de salud y proporcionar señales para identificar cambios en las trayectorias de bienestar y proporcionar información para unir a los pacientes correctos con los medicamentos correctos, primero en ensayos clínicos, luego en la práctica clínica. La iniciativa Human SRMAtlas empujala proteómica está firmemente en la vanguardia y proporciona más municiones para que la proteómica desempeñe un papel importante en los esfuerzos cada vez más mundiales de Cancer Moonshot.
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto de Biología de Sistemas . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
Referencia del diario :
Cite esta página :