El glucógeno se encuentra en forma de gránulos en el citosol en muchos tipos de células.

Los hepatocitos células hepáticas tienen la concentración más alta de este: hasta 8% del peso fresco en un estado bien alimentado, o 100-120 g en un adulto.

En los músculos, el glucógeno se encuentra en una concentración mucho más baja 1% de la masa muscular, pero la cantidad total excede la del hígado.

Se encuentran pequeñas cantidades de glucógeno en los riñones, e incluso cantidades más pequeñas en ciertas células gliales en el cerebro y los glóbulos blancos.

El glucógeno juega un papel importante en el ciclo de la glucosa.

La enfermedad más común en la que el metabolismo del glucógeno se vuelve anormal es la diabetes, en la cual, debido a cantidades anormales de insulina, el glucógeno hepático puede acumularse o agotarse de manera anormal.