Los virus son las entidades biológicas más numerosas del planeta. Ahora, los investigadores del Instituto Wellcome Sanger y el Instituto Europeo de Bioinformática de EMBL EMBL-EBI han identificado más de 140.000 especies virales que viven en el intestino humano, más de la mitad de las cuales nunca han sidovisto antes.
El documento, publicado hoy 18 de febrero de 2021 en celda , contiene un análisis de más de 28,000 muestras de microbioma intestinal recolectadas en diferentes partes del mundo. La cantidad y diversidad de virus que encontraron los investigadores fue sorprendentemente alta, y los datos abren nuevas vías de investigación para comprender cómo los virus viven en el intestinoafectar la salud humana.
El intestino humano es un entorno con una biodiversidad increíble. Además de las bacterias, también viven allí cientos de miles de virus llamados bacteriófagos, que pueden infectar bacterias.
Se sabe que los desequilibrios en nuestro microbioma intestinal pueden contribuir a enfermedades y afecciones complejas como la enfermedad inflamatoria intestinal, las alergias y la obesidad. Pero se sabe relativamente poco sobre el papel que juegan nuestras bacterias intestinales y los bacteriófagos que las infectan en los seres humanos.salud y enfermedad.
Utilizando un método de secuenciación de ADN llamado metagenómica, los investigadores del Instituto Wellcome Sanger y el Instituto Europeo de Bioinformática de EMBL EMBL-EBI exploraron y catalogaron la biodiversidad de las especies virales que se encuentran en 28.060 metagenomas intestinales humanos públicos y 2.898 genomas aislados bacterianos cultivados a partir deel intestino humano.
El análisis identificó más de 140.000 especies virales que viven en el intestino humano, más de la mitad de las cuales nunca se habían visto antes.
El Dr. Alexandre Almeida, becario postdoctoral en EMBL-EBI y el Instituto Wellcome Sanger, dijo: "Es importante recordar que no todos los virus son dañinos, pero representan un componente integral del ecosistema intestinal. Por un lado, la mayoría de los virusdescubrimos que tienen ADN como material genético, que es diferente de los patógenos que la mayoría de la gente conoce, como el SARS-CoV-2 o el Zika, que son virus de ARN. En segundo lugar, estas muestras provienen principalmente de personas sanas que no comparten ningunaenfermedades. Es fascinante ver cuántas especies desconocidas viven en nuestro intestino y tratar de desentrañar el vínculo entre ellas y la salud humana ".
Entre las decenas de miles de virus descubiertos, se identificó un nuevo clado altamente prevalente, un grupo de virus que se cree que tienen un ancestro común, al que los autores se refieren como Gubaphage. Se encontró que este es el segundo más comúnclado de virus prevalente en el intestino humano, después del crAssphage, que fue descubierto en 2014.
Ambos virus parecen infectar tipos similares de bacterias intestinales humanas, pero sin más investigación es difícil conocer las funciones exactas del Gubaphage recién descubierto.
El Dr. Luis F. Camarillo-Guerrero, primer autor del estudio del Wellcome Sanger Institute, dijo: "Un aspecto importante de nuestro trabajo fue asegurar que los genomas virales reconstruidos fueran de la más alta calidad. Un riguroso control de calidad acopladocon un enfoque de aprendizaje automático nos permitió mitigar la contaminación y obtener genomas virales altamente completos. Los genomas virales de alta calidad allanan el camino para comprender mejor qué papel juegan los virus en nuestro microbioma intestinal, incluido el descubrimiento de nuevos tratamientos como los antimicrobianos de origen bacteriófago."
Los resultados del estudio forman la base de la Base de datos de fagos intestinales GPD, una base de datos altamente curada que contiene 142,809 genomas de fagos no redundantes que serán un recurso invaluable para quienes estudian los bacteriófagos y el papel que desempeñan en la regulación de la saludtanto nuestras bacterias intestinales como nosotros mismos.
El Dr. Trevor Lawley, autor principal del estudio del Instituto Wellcome Sanger, dijo: "La investigación de bacteriófagos está experimentando un renacimiento. Este catálogo de alta calidad y gran escala de virus intestinales humanos llega en el momento adecuado para servir como unmodelo para guiar el análisis ecológico y evolutivo en futuros estudios de viromas ".
Fuente de la historia :
Materiales proporcionado por Instituto Wellcome Trust Sanger . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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