Algunas especies de pez mandarín Sinipercidae son comedores de peces puros, que se alimentan exclusivamente de peces juveniles vivos, también de su propia especie. Un equipo de investigación dirigido por la Universidad Agrícola Huazhong de China HZAU y el Instituto Leibniz de Agua DulceEcology and Inland Fisheries IGB ha descrito el genoma de cuatro especies de pez mandarín y, por lo tanto, también ha identificado genes para el comportamiento alimenticio caníbal. El conocimiento de las conexiones entre el genoma y el comportamiento alimentario es de interés para la acuicultura sostenible.
La mayoría de las larvas de peces se alimentan de zooplancton pequeño, fácilmente digerible. No así algunas especies de pez mandarín. Estos son "comedores de peces" puros ya después de la eclosión y se alimentan de peces jóvenes de otras especies de peces y de conespecíficos. Este canibalismo conduce a unalta tasa de mortalidad de peces juveniles y pérdidas económicas en acuicultura.
32 genes hacen la diferencia para los caníbales
Los investigadores compararon las secuencias del genoma de diferentes especies de pez mandarín y, por lo tanto, pudieron rastrear la evolución de 20,000 genes durante un período de 65 millones de años. Pudieron vincular muchos genes con características específicas de la especie ".estos genes en evolución, pudimos demostrar experimentalmente diferentes expresiones génicas en especies de peces mandarina que son comunes a otros alimentos y en especies que comen peces ", explica Ling Li, uno de los primeros autores del estudio y científico invitado de HZAU enel IGB.
Adaptación evolutiva rápida en comportamiento depredador
Los peces mandarines son depredadores agresivos. Durante el complejo análisis del genoma, los investigadores identificaron los llamados genes candidatos que están asociados con una agresión particularmente alta y afectan el comportamiento. "Nuestros análisis genómicos muestran el desarrollo evolutivo del pez mandarín. Se han adaptado rápidamente acondiciones ambientales cambiantes, especialmente con respecto a su comportamiento de alimentación. Hoy en día, algunas especies de pez mandarín son depredadores más agresivos que otros debido a su predisposición genética ", dice el profesor Xu-Fang Liang de HZAU.
"La investigación sobre la relación entre el código genético y el comportamiento de alimentación es una base importante para la acuicultura sostenible de estos peces. En el futuro, los acuicultores podrán utilizar la selección basada en marcadores para elegir peces para la cría donde el genoma indica menos depredadorescomportamiento, y así reducir las pérdidas ", resume el Dr. Heiner Kuhl, bioinformático líder del proyecto desde el IGB.
Investigación de genoma de alto rendimiento en IGB
El genoma de referencia para Siniperca chuatsi es uno de los genomas de peces de más alta calidad hasta la fecha. Se analizó utilizando técnicas de secuenciación de tercera generación y tiene una continuidad de secuencia muy alta y una reconstrucción casi completa de los 24 cromosomas. El genoma de referencia de alta calidad habilitadola secuenciación rentable de otras tres especies de la familia Sinipercidae por medio de la genómica comparativa. Este enfoque para crear secuencias del genoma para familias taxonómicas enteras de organismos podría servir como modelo para proyectos genómicos a gran escala.
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Materiales proporcionado por Forschungsverbund Berlin . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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