El verano pasado, los agricultores del Medio Oeste tuvieron una sorpresa desagradable después de plantar semillas nativas en acres del Programa de Reserva de Conservación. El amaranto Palmer, la hierba agresiva y difícil de matar, se había establecido en masa. Como posible solución, algunos estados declararon a Palmeruna hierba nociva, que prohíbe su venta y transporte.
"He tenido productores de semillas que me llaman", dice Pat Tranel, científico de malezas moleculares en el departamento de ciencias de cultivos de la Universidad de Illinois. "Sus negocios están en el aire debido a esto. A menos que tengan una forma de certificarsu producto no contiene Palmer, no pueden venderlo "
El método de prueba típico consiste en cultivar una muestra de semillas hasta que las plantas sean lo suficientemente grandes como para ser identificadas, pero este es un proceso lento y potencialmente poco confiable.
"Todo lleva mucho tiempo y, a veces, las semillas no germinan durante la prueba", dice Tranel. "Alternativamente, hay una compañía que probará semillas individuales mediante secuenciación de ADN, pero están cobrando $ 100 por semilla.No es rentable ".
Brent Murphy y el estudiante de posgrado desarrollaron una solución a estos problemas. Su método de bajo costo puede identificar el ADN de amaranto de Palmer dentro de una muestra mixta sin tener que cultivar las plantas. El ensayo, que utiliza un método conocido como PCR cuantitativa, puededetectar variaciones genéticas exclusivas de Palmer incluso cuando se inunda con muestras de especies estrechamente relacionadas, incluido el cáñamo
"Palmer, alga roja, cáñamo, todos tienen pequeñas semillas negras que básicamente se ven iguales. Necesitábamos una manera de extraer eficientemente el ADN de las muestras de semillas agrupadas y, si está presente, identificar a Palmer", dice Tranel.
Una vez que Tranel y Murphy desarrollaron este ensayo, trabajaron con U of I Extension's Plant Clinic para optimizar la prueba para muestras de semillas mixtas. Diane Plewa, especialista en extensión de diagnóstico y la técnica de Plant Clinic Elizabeth Phillippi, comenzaron a probar diferentes métodos para extraer ADN de la semilla.El ensayo es muy sensible, pero si el ADN no se extrae correctamente de una semilla de amaranto Palmer en una muestra mixta, no se detectará.
"El truco", dice Plewa, "es asegurarse de que cada semilla se muele durante el proceso de extracción".
Los investigadores pudieron detectar consistentemente una sola semilla de amaranto Palmer cuando se mezclaron con 99 semillas de cáñamo, y creen que el ensayo podría lograr una sensibilidad aún mayor con un refinamiento adicional.
The Plant Clinic ha optimizado un protocolo para pruebas comerciales de lotes de semillas. "Tenemos una prueba en la que nos sentimos muy seguros", dice Plewa. "Estamos ofreciendo el servicio ahora, por $ 50 por muestra". Para obtener más información,llame al 217-649-3941 o visite el sitio web de Plant Clinic.
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Materiales proporcionado por Facultad de Ciencias Agrícolas, del Consumidor y del Medio Ambiente de la Universidad de Illinois . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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