Utilizando un modelo computacional que desarrollaron, investigadores de la Facultad de Medicina de la Universidad de Pittsburgh descubrieron más de 500 nuevas interacciones proteína-proteína PPI asociadas con genes relacionados con la esquizofrenia. Los hallazgos, publicados en línea en npj esquizofrenia , una revista de Nature Publishing Group, podría conducir a una mayor comprensión de los fundamentos biológicos de esta enfermedad mental, así como señalar el camino hacia los tratamientos.
Ha habido muchos estudios de asociación de todo el genoma GWAS que han identificado variantes genéticas asociadas con un mayor riesgo de esquizofrenia, pero en la mayoría de los casos se sabe poco sobre las proteínas que estos genes producen, qué hacen y cómo interactúan., dijo el investigador principal Madhavi Ganapathiraju, Ph.D., profesor asistente de informática biomédica, Pitt School of Medicine.
"Los estudios de GWAS y otros esfuerzos de investigación nos han mostrado qué genes podrían ser relevantes en la esquizofrenia", dijo. "Lo que hemos hecho es el siguiente paso. Estamos tratando de comprender cómo estos genes se relacionan entre sí, lo que podría mostrarnosotros las vías biológicas que son importantes en la enfermedad ".
Cada gen hace que las proteínas y las proteínas interactúen entre sí en un proceso biológico. La información sobre las parejas que interactúan puede arrojar luz sobre el papel de un gen que no ha sido estudiado, revelando vías y procesos biológicos asociados con la enfermedad y también su relacióna otras enfermedades complejas.
El equipo del Dr. Ganapathiraju desarrolló un modelo computacional llamado Predicción de interacción de proteínas de alta precisión HiPPIP y lo aplicó para descubrir PPI de genes relacionados con la esquizofrenia identificados a través de GWAS, así como genes de riesgo históricamente conocidos. Encontraron 504 nunca antes conocidosPPI, y señaló también que si bien los genes vinculados a la esquizofrenia identificados históricamente y a través de GWAS tenían poca superposición, el modelo mostró que compartían más de 100 interactores comunes
"Podemos inferir lo que podría hacer la proteína al verificar la compañía que mantiene", explicó el Dr. Ganapathiraju. "Por ejemplo, si sé que tiene muchos amigos que juegan al hockey, podría significar que está involucrado en el hockey,De manera similar, si vemos que una proteína desconocida interactúa con múltiples proteínas involucradas en la señalización neural, por ejemplo, existe una alta probabilidad de que la entidad desconocida también esté involucrada en la misma ".
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Materiales proporcionado por Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad de Pittsburgh . Nota: el contenido se puede editar por estilo y longitud.
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