La secuenciación y el análisis comparativo del genoma del ácaro depredador Western Orchard ha revelado una dinámica evolutiva genómica intrigantemente extrema a través de un esfuerzo de investigación internacional codirigido por científicos de la Universidad de Ginebra y el Instituto Suizo de Bioinformática SIB. En un estudio publicadoen el diario Biología y evolución del genoma los investigadores detallan las ideas iniciales sobre varias características notables del genoma de este ácaro agrícolamente importante que se emplea ampliamente para controlar las plagas de plantas, con miles enviados a los productores de frutas todos los días.
Como un enemigo natural importante de varias plagas agrícolas dañinas, el ácaro depredador Metaseiulus occidentalis se usa en muchos entornos agrícolas como un agente de control biológico efectivo. Algunas de sus presas favoritas incluyen los ácaros que se alimentan y destruyen varias frutas, como fresas, manzanas, duraznos y uvas. "He estado estudiando el comportamiento, la ecología y la biología molecular de estos ácaros durante más de 40 años", dijo la profesora Marjorie Hoy, autora principal de la Universidad de Florida, Estados Unidos, "así que tenía muchas ganas de secuenciar".todo el genoma para revelar el catálogo completo de genes ". Para explorar la biología única de este depredador agrícolamente importante, los investigadores centraron sus estudios en genes implicados supuestamente en procesos relacionados con la parálisis y la digestión pre-oral de especies de presas y su sexo parahaploide bastante raro.sistema de determinación, así como también cómo detecta señales químicas de su entorno y se defiende de las infecciones.
En comparación con otras especies de artrópodos, la historia evolutiva del genoma de este ácaro ha sido particularmente dinámica. Por ejemplo, los análisis del equipo revelaron notablemente más ganancias y pérdidas de intrones que en otros artrópodos ". Las ganancias y pérdidas dinámicas de intrones en los genes deeste ácaro está en marcado contraste con su pariente más cercano con un borrador del ensamblaje del genoma, la garrapata Ixodes "describió al Dr. Robert Waterhouse, autor principal de la Universidad de Ginebra y el Instituto Suizo de Bioinformática SIB. Identificaron cinco copias de Dicer-2, ungen encontrado casi exclusivamente en una sola copia en otros artrópodos, lo que sugiere un posible cableado de las rutas de procesamiento de ARN. Los genes Hox, que son importantes para determinar los planes del cuerpo animal y se encuentran en un grupo de genes vecinos en casi todas las especies examinadas hasta la fecha,se descubrió que estaban completamente dispersos en el genoma del ácaro ". Esto plantea preguntas sobre cómo los programas reguladores que activan y desactivan los genes Hox durante el coorEl desarrollo dinado de planes corporales complejos se puede lograr incluso cuando los genes ya no están físicamente cerca uno del otro en el genoma ", explicó el Dr. Waterhouse.
"Estos recursos mejoran en gran medida el muestreo genómico de los queliceratos, un grupo de artrópodos que hasta ahora ha estado mal representado principalmente debido a los desafíos asociados con sus genomas a menudo muy grandes", dijo el profesor Stephen Richards, del Baylor College of Medicine USA, dondese realizó la secuenciación del genoma. De hecho, los resultados de los análisis filogenómicos del estudio cuestionan las relaciones entre algunos de los principales grupos de quelicerato de ácaros, garrapatas y arañas, enfatizando aún más la necesidad de un muestreo genómico mejorado en este clado. Por lo tanto, este ensamblaje del genoma de referencia proporcionavaliosos recursos nuevos de alta calidad para futuros análisis genómicos y taxonómicos funcionales de esta familia de ácaros depredadores y otros arácnidos.
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Materiales proporcionado por Instituto Suizo de Bioinformática . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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