Imagine los descubrimientos científicos que resultarían de una base de datos en línea con capacidad de búsqueda que contiene millones de registros de muestras de plantas, algas y hongos. Gracias a un nuevo conjunto de módulos de flujo de trabajo para digitalizar colecciones de muestras actualmente preservadas en herbarios, algo así podría estar al alcanceLos módulos son proporcionados por las Biocollecciones Integradas Digitalizadas de la National Science Foundation NSF iDigBio, que está facilitando un esfuerzo colectivo para unificar proyectos de digitalización en todo el país.
"El herbario de América del Norte cura aproximadamente 74 millones de especímenes y solo una fracción lo ha hecho en línea", dice el especialista en digitalización de iDigBio, el Dr. Gil Nelson. "Tener estos datos disponibles al alcance de la mano permitirá consultas avanzadas y nuevos descubrimientos al tiempo que garantiza la inclusión de loslos llamados 'datos oscuros' que residen en un porcentaje significativo de los más de 600 herbarios activos de los Estados Unidos "
Según estimaciones recientes, aproximadamente la mitad de los herbarios y universidades de EE. UU. Aún no han comenzado a movilizar datos. Nelson coordinó el desarrollo de los flujos de trabajo, trabajando junto con otros 28 autores contribuyentes, para brindar orientación a las instituciones que recién comienzan programas de digitalización, así como a aquellas que buscanpara racionalizar y ajustar su configuración de digitalización actual.
Los 14 módulos, cada uno organizado en siete a 36 tareas fáciles de seguir y personalizables, cubren todo, desde la creación de una estación de imágenes hasta la georreferenciación. También incluyen métodos para organizar eventos de divulgación para la participación del público en imágenes y transcripción de datos.se pueden descargar como formato de documento portátil PDF y archivos de procesamiento de texto editables en GitHub y como archivos PDF en iDigBio. Una descripción completa de los flujos de trabajo y su desarrollo, junto con archivos de procesamiento de texto editables de los módulos de flujo de trabajo, está disponible en la edición de septiembrede Aplicaciones en Ciencias de las plantas .
iDigBio lanzó por primera vez grupos de trabajo en 2012 para abordar un déficit en los datos de biodiversidad en línea. Seis módulos iniciales provocaron un aumento en la digitalización, pero la evolución de la digitalización y las prácticas curatoriales hicieron posible listas de tareas más completas. El último conjunto de módulos es el resultado de la continuacióncolaboraciones, reuniones virtuales, visitas a muchos herbarios, talleres de iDigBio con más de 50 investigadores y contribuciones de 15 proyectos de digitalización financiados por NSF.
"El mayor desafío en la producción de flujos de trabajo genéricos y ampliamente aplicables fue determinar y presentar una declaración de consenso de los componentes acordados al tiempo que se conserva la máxima flexibilidad para la implementación institucional en una amplia gama de herbarios", dice Nelson.
Para Nelson, la digitalización es el punto de partida de nuevas vías para guiar la investigación biológica y ecológica. Visualiza enormes conjuntos de datos multiorgánicos que permitirán a los investigadores estudiar relaciones ecológicas, biológicas y culturales aún por reconocer. El trabajoen iDigBio está sentando las bases para un recurso en línea muy poderoso.
iDigBio proporciona educación y recursos de digitalización a instituciones en todo Estados Unidos y está financiado por el programa Avanzado de Digitalización de Colecciones de Biodiversidad ADBC de la NSF.
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Materiales proporcionados por Sociedad Botánica de América . Nota: El contenido puede ser editado por estilo y longitud.
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